Grupul de legare a peptidelor - ghidul chimistului 21

Chimie și Tehnologie Chimică

Unități monomere. din care sunt construite proteine, sunt 20 a-aminoacizi. Aceste molecule mici sunt înzestrați cu o proprietate comună tuturor moleculelor capabile să polimerizeze ele conțin cel puțin două grupe chimice diferite, capabile să reacționeze între ele pentru a forma o legătură covalentă. In astfel de grupări amino sunt amino (-YNg) și gruparea carboxil (-COOH), și legătura care este determinată de formarea polimerului de proteine. este o legătură peptidă (amidă). formarea legăturii peptidice poate fi gândită ca eliminarea moleculelor de apă din reunirea -COOH și -NH2-gpypp [ecuația (2-7)]. Mediul apos în reacțiile de echilibru ale acestui tip este deplasată spre formarea de aminoacizi liberi în locul peptidei. Prin urmare, sinteza peptidelor (ca și in vivo. Și în laborator) se efectuează în mod indirect și nu se limitează la simpla eliminare a apei. [C.80]








Pe baza rezultatelor studiilor de difracție cu raze X, au fost stabilite distanțele interatomice și unghiurile de valență caracteristice grupurilor de peptide. Pe baza acestor date, au fost prezenți parametrii standard ai distanțelor interatomice și unghiurilor de valență ale grupurilor de peptide. Pentru compușii diferiți, abaterile de la aceste valori standard sunt posibile în câteva sutime de un angstrom în lungimi de legătură și în limitele de valență de 3-4 °. Aceste deviații sunt explicate prin stresul care apare în părțile individuale ale structurii, formând o împachetare densă a moleculelor în cristale. Parametrii standard pentru grupurile de peptide sunt arătați în Fig. 11 După cum au demonstrat studiile multor compuși. lungimea legăturii peptidice -C-N variază în domeniul 0,02-0,03 A aproape de valoarea medie 1,35 A. Această distanță nu corespunde lungimii [c.537]







Dar primele minute de lucru cu modelele nu ne-au adus mult bucurie. Deși erau doar o duzină de atomi, ar fi adesea să cadă din cleme stricate, care trebuiau să le păstreze la o distanță corespunzătoare una de cealaltă. Mai rău, a existat o impresie neplăcută că unghiurile de valență ale celor mai importanți atomi nu sunt supuse nici unei reguli. Nu promite nimic bun. Pauling a stabilit structura lui a-helix, știind ferm că grupurile de peptide sunt plane. Iar aici, pentru marele nostru supărare, se părea că sa dovedit că legăturile de fosfodiester. care conectează nucleotidele adiacente din ADN, aproape sigur pot avea cea mai diversă formă. În orice caz, ne lipsea intuiția chimică. Pentru a identifica o singură configurație care ar fi mult mai elegantă decât toate celelalte. [C.57]


Prin urmare, legătura C-N din grupul peptidic este similară cu cea dublă, care este de asemenea accentuată de lungimea sa (0.132 nm), care este mai mică decât lungimea unei legături simple. Se presupune că contribuția structurii ionice este de aproximativ 40%. Această circumstanță conduce la o concluzie importantă că grupul C-N este plat și trebuie să existe în două forme [c.176]

O legătură disulfurică are loc între resturile de cisteină care aparțin lanțurilor diferite. Atomii de sulf din grupele -SH ale celor două resturi de aminoacizi care rezultă din scindarea oxidativă sunt atomi de hidrogen conectate în același mod în care acestea sunt unite în molecula cistina (p. 287). Legăturile de hidrogen se formează datorită atomului de hidrogen (pagina 106) între atomii de azot și oxigen ai grupărilor peptidice. De exemplu, [c.292]







Articole similare

Trimiteți-le prietenilor: