După cum se poate observa din schema de formare a peptidelor, lanțul polipeptidic are o anumită direcție, deoarece are capetele opuse fiecare dintre blocurile sale de construcție (unități de aminoacizi sau resturile de aminoacizi) - amino sau grupa N-sau C-carboxil. Reziduul de aminoacid de la capătul moleculei, în cazul în care există o cantitate liberă # 945; -amino grup este numit N-terminal rest (capătul N-terminal al moleculei), iar la capătul opus al unui rest având o grupă carboxi liberă, - C-terminală (C-terminal al moleculei). De exemplu, pentru o tripeptidă:
N-capăt → (H2N) ala-gli-trei (OH) ← C-capăt
(începutul lanțului) (sfârșitul lanțului)
Se presupune în mod convențional că lanțul polipeptidic începe la capătul N-terminal, adică end Grupul amino; Pentru înregistrarea condiționată a peptidelor, se folosesc abrevieri cu trei litere # 945; - aminoacizii (vezi p. 5). Când secvența aminoacizilor este prezentată în lanțul peptidic, acestea încep cu restul de N-terminal. Astfel, în tripeptidă ala-gli-trei alanină poartă gruparea amino terminală și gruparea carboxil triptofan-terminal. Rețineți că trigli-ala este o altă tripeptidă!
Numele peptidelor se formează din numele trivial al resturilor de aminoacizi conform secvenței lor, începând cu restul N-terminal. Reziduul C-terminal își păstrează numele trivial. Denumirile resturilor de aminoacizi produși din denumirile de aminoacizi corespunzătoare prin înlocuirea acestora cu închiderea final pe „il“ resturile monovalente caracteristice (radicalii) nume. De exemplu, glicină (reziduu - glicil), valină (reziduu - valil), fenilalanină (reziduu - fenilalanil), asparagină (reziduu - aspartil) acid aspartic (rest - asparaginil) etc.
Tripeptida ala-gly-trei va fi după cum urmează: alanil-glicil-triptofan.
Dacă reziduul de aminoacizi se repetă în lanț mai mult de o dată la rând, atunci înainte de a folosi numele se utilizează prefixul corespunzător: de 2 ori - di, 3 - trei, 4 - tetra etc. De exemplu, Pentapeptida Lys - (aproximativ) 2 - tragere - Gin va fi numit: lizil - diprolil - tirozil - glutamina.
Dacă există un acid glutamină sau aspartic în peptidă ca reziduu C-terminal, acestea se numesc glutamat și, respectiv, aspartat, într-un singur cuvânt. De exemplu, numele tetrapeptidei pro-ile-asp-asp este: prolyl-izoleucil-asparaginil-aspartat.
Articole similare
Trimiteți-le prietenilor: