Studiul complexării valinomicinei cu diferiți cationi a arătat o selectivitate extrem de ridicată a acestei complexone în raport cu tipul de cation. Aceasta se datorează mărimii situsului de legare a cationilor din molecula de valinomicină. Astfel, ionul de potasiu se potrivește exact în centrul de legare. iar ionul de sodiu, având o dimensiune ceva mai mică, nu rămâne în interiorul moleculei și alunecă prin ea. Prin urmare, valinomicina oferă un transfer preferențial de membrană neagră de potasiu (în comparație cu sodiu). [C.130]
Molecule de ATP citoplasmă se leaga de centrul activ al unuia dintre o-ATPase subunitate (conformație aderare E. legarea ATP este însoțită de trei ioni de sodiu. Aceasta activează activitatea catalitică a enzimei. Hidroliza ATP are loc, gruparea fosforilată carboxil din catena laterală a unei alte subunități rest de acid aspartic . [c.312]
Recent, alte funcții importante ale organismului pentru N3 + au fost stabilite, menite să schimbe ambalarea acizilor nucleici și a proteinelor, deoarece legarea de sodiu de către centrele ionice de macromolecule le poate stabiliza în anumite conformații. Capacitatea lui K + de a stabiliza structura macromoleculelor diferă brusc de cea a Ka +. [C.106]
Această reacție stă la baza metodei utilizate pe scară largă de detectare a bazelor Schiff în proteine și de introducere a etichetelor izotopice. De exemplu, este posibil să se utilizeze o aldehidă sau o amină marcată cu izotop sau să se introducă o etichetă radioactivă. utilizând borohidrura de sodiu care conține H (așa-numita borotitridă) pentru reducerea reacției (7-39). substrat de hidroliză suplimentară a proteinei (acidă sau enzimatică) permite determinarea cu orice grupă laterală aminoacid a fost legat și de hidroliză parțială permite localizarea situsului de legare în lanțul peptidic. [C.144]
Succinatul de ubichinon-reductază (SUR) catalizează oxidarea succinatului cu ubiquinona. Conform datelor de electroforeză, în gelul de poliacrilamidă în prezența dodecilsulfatului de sodiu, enzima constă din polipeptide 3 - 4. Subunitățile cu greutăți moleculare de 70.000 și 28.000 Da sunt de fapt succinat dehidrogenază. substratsvyazyvayuschem în centrul căruia succinat de dehidrogenare și componentele cu greutate moleculară mică ale complexului (15 000 m Da. m. aprox.) da reactivitatea dehidrogenază succinat la ubichinonă. sensibilitatea la inhibitori specifici și, aparent, să participe la legarea enzimei în membrană. Izolarea RMS preparat enzimatic se bazează pe extracția din membrană folosind detergent neionic Triton X-100 și concentrația medicamentului de acetonă răcită. În continuare fracționare cu sulfat de amoniu și purificare pe gel Kaldo-fosfat posibil pentru a obține o enzimă de înaltă puritate în stare cu activitatea catalitică a aproximativ 25 umol de succinat oxidat la 1 min [c.423]
Potasiul și sodiul pot pătrunde cu ușurință în fazele lipidice. Zonele de membrană fosfolipidă care conțin fosfosaharide acumulează în mod mai eficient potasiu. Proprietățile ligandului proteinelor sunt foarte complexe. Moleculele de proteine conțin centri ionici și dipoli. Legarea calciului cu anionii este una dintre căile de a forma legăturile dintre proteine. Glicoproteinele membranelor se leagă bine, la fel ca și cationii K + și Na +. În plus, K +, Na + și Ca + pot fi localizate în membrane ca ioni în mișcare liberă în canalele selective, precum și în straturile admembrane. [C.34]
Gradienții de sare sunt cele mai comune metode de eluție a proteinelor din schimbătorii de ioni. Deoarece modificările pH-ului în coloană pot fi menținute prin tamponarea proteinelor și grupurilor purtătoare, sărurile curg liber prin coloană, dacă nu sunt schimbate pentru contraioni. Dar chiar și în acest caz, concentrația de sare rămâne la același nivel, deși compoziția sa variază. De regulă, pentru a produce gradientul, se utilizează un gradient de clorură de potasiu sau de clorură de sodiu utilizând un mixer simplu (a se vedea figura 4.19). Ne putem imagina două căi de acțiune ale sărurilor. Sarea poate deplasa în mod direct ionii de proteine (de exemplu, ionii de clor în adsorbenți DEAE) ocupă poziții de legare pozitivă și blochează atașarea proteinelor la acestea. Se poate de asemenea presupune că întregul sistem este într-o stare de echilibru. la care chiar proteine cu legare puternică rămân neabsorbite de ceva timp în prezența ionilor de sare, atracția dintre proteina liberă și adsorbantul este mult atenuată. În orice caz, proteina desorbită este înlocuită cu ioni încărcați opus, [c.115]
Sub cataliza ionică, acțiunea otrăvii este redusă la legarea ionilor catalitic activi localizați pe suprafață. În cazul celor mai răspândite cazuri de cataliză ionică acidă, otrăvirea apare atunci când centrele de aciditate ale suprafeței sunt neutralizate. Prin urmare, bazele, inclusiv alcalii și compuși amini, sunt otrăvuri catalitice. Deoarece ionii activi ai unor astfel de catalizatori acide cum ar fi aluminosilicații ocupă doar 2-3% din suprafața totală a catalizatorului. o cantitate mică de otrăvire, de exemplu hidroxid de sodiu sau o bază de piridină. "suficient pentru a otrăvi catalizatorul. [c.53]
Eficacitatea observată a reacției a fost explicată prin efectul de matrice al ionului de sodiu. care se datorează formării coordinare cu atomii de oxigen se poate stabiliza în mod eficient o cvasi-ciclică substrat conformație 318 pas ciclizare ua. Acest lucru asigură convergența forțată a centrelor reactive, facilitând în mod drastic formarea unui produs ciclic - 315a complex de sodiu, și dă un decomplexing trecut 18 atomi coroană eter 315. Aceeași reacție când încearcă în prezență de hidroxid de litiu sau amoniu dă 315, și conduce la formarea esteri oligomerici aciclici. Studiile ulterioare au confirmat în mod fiabil validitatea conceptului de legare multicentrică. și pe această bază sa dezvoltat un domeniu independent de chimie organică. despre care vom vorbi mai detaliat în Ch. 4, [c.224]
Davis. James și Lecky [2036] au susținut teoria legării centrelor. făcând un nou pas în dezvoltarea sa. Ei au sugerat că se formează complecși de suprafață în plus față de ionizarea simplă disponibilă a grupărilor OH pe suprafață chiar și în cazul ionilor de sodiu. Un program compilat pentru un calculator a fost utilizat pentru a găsi starea de echilibru în soluție și au fost luate în considerare un număr mare de variabile. Rezultatele obținute arată că fie un cation cu un centru încărcat pe suprafață formează o pereche de ioni. fie complexul de suprafață este inexistent. Este important ca și cationii metalici simplu încărcați singuri. aparent, se leagă la suprafață datorită coordonării cu atomul de oxigen al grupului S10H. Astfel de grupe de suprafață sunt mai acide decât grupările OH ale acidului monosilicic, care probabil are o tendință mult mai mică de a forma complexe cu ioni metalici (vezi capitolul 2). [C.921]
Așa cum s-a menționat mai sus, izonitrile pot acționa ca substraturi oxidative ale azotazei [140-142]. Acestea sunt reduse la hidrocarburi care conțin atomul de carbon dintr-o grupare izonitril. și amine primare. format din fragmentul R-N. Isonitrile, precum și azotul, sunt atașate la atomii de metale tranziționale până la sfârșitul moleculei. În reducerea metil izonitrilului legat, se formează metan ca produsul principal al reacției cu șase electroni, în timp ce în reducerea moleculei izonitril necoordonate, procedeul se desfășoară în principal în dimetilamină, produsul unei reacții cu cinci electroni. Această combinație de proprietăți face izonitrile un substrat excelent în studiul ambelor azotaze biologice. și sisteme model. Atunci când cisteina de molibden din compoziția 11 este utilizată ca catalizator, principalele produse de reducere a izonitrilului cu borohidrură de sodiu sunt etilenă și etan [137]. Ca și în cazul substraturilor de acetilenă, datele experimentale sunt în concordanță cu activitatea catalitică a complecșilor monomeri de molibden. Reducerea este slab inhibată de azotul molecular și este mai eficient suprimată de monoxidul de carbon. Experimentele cu N2 au arătat că azotul ca inhibitor al acestei reacții este redus la amoniac și că moleculele de N2 și RN sunt legate de aceleași centre, aparent de atomi de molibden. În plus, azotul și monoxidul de carbon sunt inhibitori competitivi ai reducerii izonitrilor prin azotază. care demonstrează convingător prezența proprietăților de molibden necesare pentru legarea și recuperarea substraturilor. În Fig. 49 [c.318]
Pe hârtia de filtru, aplicați una după alta. 2-3 picături de soluție 10% de Na2HP04. Se pune o picătură de soluție de testare în centrul punctului umed format. După ce picura este absorbită în filtru, se adaugă o picătură de soluție de fosfat de sodiu în mijlocul locului pentru o legare mai completă a fierului și a manganului. Apoi, locul pe [c.124]
Notă. Șase reacții secvențiale majore includ legarea ionilor de sodiu la E-conformer. interacțiunea cu ATP și formarea fosforilată intermediar (etapa 1), ocluzia ionii de Na + conformație E R (etapa 2) activat ioni de tranziție E P -> E P, având ca rezultat eliberarea ionilor de Na + în mediul extracelular și legarea la centrul de ioni de potasiu extracelular (stadiul 3), ocluzia ionilor (stadiul 4), defosforilarea enzimei. Datorita care ionii sunt eliberați în spațiul intracelular (etapa 5) și tranziție konformagdii E conformație Ep condiționat începutul unui nou ciclu (etapa 6), [c.44]
TOB dobândește o afinitate pentru situsul de legare individuală în locul activ al enzimei. care pot fi desemnate în mod condiționat în funcție de natura substraturilor obligatorii. Un situs de legare pentru o-dianisidină și celălalt este hidrochinona (Figura 59). În regiunea o-di-anisidină, pe lângă o-dianisidina, clorpromazina se poate lega între substraturile studiate. IAA, triptofan. strofantin G, acid ascorbic. NADH, amida III, salicilat de sodiu. și în regiunea hidrochinonă - ferocianura de potasiu. triftazin. thiopperazină, digoxină. Mai mult, substraturile care se leagă într-o zonă pot concura cu inter-parte pentru site-ul de legare, care se manifestă prin oxidarea lor diferențiată. În acest caz, selectivitatea este determinată de natura substratului și de afinitatea acestuia pentru situsul de legare, accesibilitatea căilor de transport de electroni către hemin. [C.140]
Articole similare
Trimiteți-le prietenilor: