Nomenclatorul de peptide

După cum se poate observa din schema de formare a peptidelor, lanțul polipeptidic a determinat ?? ennoe direcție ca fiecare dintre blocurile sale de construcție (unități de aminoacizi sau resturi de aminoacizi) având capete diferite - sau N-amino sau o grupare C-carboxil. Reziduul de aminoacid de la capătul moleculei, în cazul în care există o cantitate liberă # 945 grupă amino, se numește rest N-terminal (N-end a moleculei) și la capătul opus al unui rest având o grupă carboxi liberă, - C-terminală (C-terminal al moleculei). De exemplu, pentru o tripeptidă:







N-capăt → (H2N) ala-gli-trei (OH) ← C-capăt

(începutul lanțului) (sfârșitul lanțului)

Se presupune în mod convențional că lanțul polipeptidic începe la capătul N-terminal, ᴛ.ᴇ. end Grupul amino; Pentru înregistrarea condiționată a peptidelor, se folosesc abrevieri cu trei litere # 945; - aminoacizii (vezi p. 5). Când secvența aminoacizilor este prezentată în lanțul peptidic, acestea încep cu restul de N-terminal. Astfel, în tripeptidă ala-gli-trei alanină poartă gruparea amino terminală și gruparea carboxil triptofan-terminal. Rețineți că triglic-a-϶ᴛᴏ este o altă tripeptidă!

Numele peptidelor se formează din numele trivial al resturilor de aminoacizi conform secvenței lor, începând cu restul N-terminal. Reziduul C-terminal își păstrează numele trivial. Denumirile resturilor de aminoacizi produși din denumirile de aminoacizi corespunzătoare prin înlocuirea acestora cu închiderea de capăt on''il „“ reziduuri monovalente caracteristice (radicali) nume. De exemplu, glicină (reziduu - glicil), valină (reziduu - valil), fenilalanină (reziduu - fenilalanil), asparagină (reziduu - aspartil) acid aspartic (rest - asparaginil) etc.







Tripeptida ala-gly-trei va fi după cum urmează: alanil-glicil-triptofan.

Dacă reziduul de aminoacizi este repetat în lanț mai mult de o dată la rând, atunci este folosit un prefix înaintea numelui său: de 2 ori - di, 3 - trei, 4 - tetra etc. De exemplu, pentapeptida lys - (pro) 2 - tir - gln va avea denumirea: lysil - diprolyl - tirosil - glutamina.

Dacă există un acid glutamină sau aspartic în peptidă ca reziduu C-terminal, acestea se numesc glutamat și, respectiv, aspartat, într-un singur cuvânt. De exemplu, numele tetrapeptidei pro-ile-asp-asp va fi după cum urmează: prolyl-izoleucil-asparaginil-aspartat.

Citiți de asemenea

Deoarece aminoacizii din compoziție sunt sub formă de peptide acil (reziduuri acide), peptidele care dau titlul acil caracteristic care se încheie „il“. Numele aminoacidului terminal cu gruparea carboxil liber este lăsat neschimbat (Figura 1.17). [citeste mai mult].

Deoarece aminoacizii din compoziție sunt sub formă de peptide acil (reziduuri acide), peptidele care dau titlul acil caracteristic care se încheie „il“. Numele aminoacidului terminal cu o grupare carboxil liberă este lăsat neschimbat (Fig. 1.17). [citeste mai mult].







Articole similare

Trimiteți-le prietenilor: